魔法使いのおじさんといたいけな少女

高校生となった新堂茉莉（しんどうまり）は、幼少の頃、自分を魔法使いと言うおじさんに出会う。

おじさんに何をされたか記憶がない茉莉は、自分の潔癖さに自信が持てず、男を気持ち悪いと思うようになった。

学校でイケメンと噂の先輩　創玄奏多（そうげんかなた）は、茉莉に自分が魔法使いであることを語る。本当の魔法を見せられて感激していた茉莉に、奏多は茉莉にも魔力があるという。

魔法使いは政府に管理されている存在だと知った茉莉、そして自分の魔力を消し去りたい奏多は、二人で茉莉が昔出会った魔法使いを語るおじさんの捜索を開始する。

捜索の途中で邪魔をしてくる者たち。そして、魔法使いの家系。
魔力と家族を巡る争いに巻き込まれていく茉莉。
茉莉と奏多の運命は、そして、おじさんの正体とは。