異世界帰りの暗殺者が世界を陰から支配する

　鈴木闇夜（すずきやみよ）は、魔王を倒すために異世界に召喚され、3年の年月をかけて倒した異世界帰りの暗殺者である。

　闇夜は現代に帰ると、妹の姫花（ひめか）の安全確保と両親の死の真相を知るため、魔術や異能、都市伝説などを調べ始める。
　すると意外と現代がファンタジーな事を知る闇夜。

　その事に一層危機感を示す闇夜だったが、そんな時に妹の姫花の秘密を知る。
　なんとその姫花は世界から忌諱される魔女だった。

　シスコンの闇夜は妹を守る為に追っ手を殺し、自分もターゲットにされてしまう。

　そこで闇夜は、裏世界の様々な組織に対抗するため、自身も陰の組織を作ることにした。

　しかし妹の為に作ったはずが、何故か色んな問題を抱えた少女達が集まってきて———