ある錬金術師の少女の一生

この世界を〝完成〟させた創造神である兄妹神に倣い、あらゆる物を掛け合わせ新しい物を作り出す錬金術師たち。

主人公のセレーネ・サラサは自分を拾ってくれた師匠に断れ続けられながらも諦めず、とうとう長年頼み込んでいた錬金術を学べる場所への招待状をもぎ取る……が、入学初日から遅刻してしまう。

これから先一緒に過ごす相棒として紹介されたリア・リーザスからも嫌われてしまい、前途多難なスタートを切る事になってしまったセレーネはちゃんと錬金術師として大成できるのだろうか。