僕が守りたいと思うものを、君も守りたいと思って欲しいんだ

謎の隕石が次々と地球目掛けて襲来してくる世界。
世界の希望は、そんな隕石を撃退するべく戦闘ロボットに乗って戦う少年少女たち『ガンツァーヘッド』に託されるのであった。

ある日、まだまだ未熟なガンツァーヘッドである少年スバルに、新人の少女チャイカの教育係という命が下る。
新人ながらあらゆることでスバルを上回る力を見せるチャイカ。しかしそれ以上にスバルが困惑したのは、チャイカ自身がまるでロボットかのように人間らしい心を持ち合わせていないことであった。

劣っているスバルがチャイカに教えてあげることができるもの。
それは自分たちが何を守る為に戦っているのか、ということ。

今、その想いを胸にスバルとチャイカは巨大隕石に立ち向かう！