理科から始まる、少年たちの夢

中学生の頃、勉強に真面目に取り組むことができなかった実口 徹（みのぐち とおる）。
学校では友人もおらず、二年間、授業をまともに受けることはなかった。特に理科に対しては苦手意識をもち、熱心に取り組む気にはなれなかった——。

そんな生活のまま、彼は中学三年生になる。
入学式準備のときに仕事をさぼっていた実口は、同学年で名を馳せる糸坂 礼慈（いとさか れいじ）に叱責される。
これまでは何の関係もなかった二人だったが、その後、実口はなぜか糸坂に興味をもたれ、糸坂の言う「秘密の友達」になっていく。
次第に、彼は糸坂から勉強を教えてもらうようになるが——。

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なぜ糸坂は実口に勉強を教えるようになったのか。
“先生”の過去とは——！？

二人の少年の青春物語。