夢幻の世界に誘われ

大学の講義の後、誘われていた飲み会に向かっていた男子大学生の『雨宮　乃亜』（あまみや　のあ）は、店への近道のためにいつものように路地裏を通り抜ける。
しかし、目の前に広がるのは色を失った世界だった。
自分以外誰一人いない世界に困惑していると、異形の怪物が乃亜を襲う。
絶体絶命のその時、白い髪をたなびかせ、長槍と炎を操る女性が乃亜の前に現れた。
その女性、『雪白　奏』（ゆきしろ　かなで）に助けられ、モノクロの世界を脱出する。
裏の世界に足を踏み入れた乃亜は、奏の所属する組織『方舟』に保護されることとなった。
これは大学生としての普通の日常と方舟の一員としての非日常を過ごすことになった乃亜と奏の物語。