I.L.I.A -Link to Heart-

未来の終末世界。136年前、突然地球に急接近した彗星。その影響で地上の人口の7割が死滅、地上の文明のおよそ9割が崩壊。この地球規模の災害を、「地上陥落」と言う。

地上はその間、人が生存不可能なほどの高密度の汚染物質で覆われていたため、時間をかけて浄化。その年月は130年以上にも及ぶ。

幸いにも人類は地下にも開拓を進めていたため、重要な統制機関などは3割ほど生き残っていた。人類は、再び復興のために、荒れ果てた地上を散策および修復にあたる。
現在は人類のほとんどは地下で生活している。

ある日、地上の生き残っている施設からとあるＡＩの少女を回収。彼女は人と同じように笑い、怒り、泣き、やがて人間に恋をする。