結局のところ、魔王はとっくの昔に生まれてしまっていたのでした。

使える魔法に制限のある魔法使いの少女、セリシア。それでも強くなるために、何故か洞窟に引き籠っている魔法の天才、アリスに師事をして旅に出る。二人がアリスの兄弟子であるプルートの元を訪ねると、プルートは既に魔族に襲われて死亡していた。
なぜ、都市の中心部に魔族が居たのか。本当に彼は、魔族に殺されたのか。
謎の多い彼の死から、セリシアはこの世界の残酷な仕組みを理解していくことになる。