揺れる空の下でキミの温もりを

第三次世界大戦が勃発。日本は早々に核を落とされて敗戦した。
すぐに敵軍が上陸して全土を支配した。彼らは徐々に残忍さを増していく。

高校生のアカリとハヤトの通う学校にも敵軍が訪れた。敵軍は学校で銃を乱射し、生徒を次々と殺していった。
二人の命が尽きようとした時、ハヤトが祖母からもらったお守りの「赤球」が反応。赤球から放たれた光が周囲の時間を止め、あらゆる物を破壊し、二人の命を救った。

赤球の破壊力は現代兵器の域をはるかに超えていた。赤球があれば敵軍から日本を取り戻すことも夢では無かった。
だが起動方法が分からない。二人は赤球の謎を追い始める。