WE部へようこそ！

自然と花を愛する少年、亀鶴 美知留。
高校では園芸部に入り、穏やかな学園生活を送るはずだった。

だが現実は、二人の姉の命令で女装し、女子校へ入学という地獄のスタート。
逆らえない性格のせいで、今日も運命に流されるまま登校する。

そんな彼に目をつけたのは、学園の有名人、市二神マキナ。

「ねぇ、あなた？　WE部に入りなさい」

またしても命令され、入部することになってしまう。
しかもその部活には、とんでもない活動内容が隠されていた。

「さぁ、今日も世界を滅ぼすわよ！」
「……はい？」

美知留の平穏な園芸ライフは、今日も遠ざかっていく――