＞＞[前略]ただしダンジョンの効果は階層を降りるごとに強化させる。一階層降りるたびに分解速度が倍になる。どんなに強力な魔物であっても、五階層より下ではなんの抵抗も許されず、一瞬で分解させる。

　文法的に、違和感のある表現が２か所あります。どちらも「させる」という部分です。
　主語が「ダンジョンの効果」にあるので、ここでは「強化される」のほうが適切かと。強化させるという表現ならば、ダンジョンがその効果を――という形のほうが、よろしいかと思います。ただし、その他の文章も加味すると、やはり特殊効果の説明だと思いますので、単に「強化される」でいいかなと思いました。
　後半の、分解させるという表現も、主体がダンジョンではなく、その効果を受ける魔物などにあるのでしょうから、「分解される」のほうが適切だと思われました。ご確認いただければ、幸いです　(*ﾟ▽ﾟ*)


＞＞　その速度は一階層の約千倍。

　細かいことなので、コメントするべきか迷ったのですが、念のため……。
　ダンジョンは全部で１０階層、かつ、分解速度が１層につき２倍になる、という説明があったかと思います。この場合、降りることが可能な階層は、最初の１層を除いた９個だけになると思いますので、計算は２の９乗になって、たぶん約千倍ではなく五百倍かと（２の１０乗なら、仰るとおり約１０００のはずですが……）。
　記憶が曖昧なので、ダンジョンが地上１層、地下１０層という話であれば、単に私の勘違いです。お許しを　(*･ω･)*_ _)


　どちらも内容についてのコメントじゃなくてすみません（汗）
　もっとも、まだストーリーが本格的に始まっていないので、触れたくても何も言えないのですが　(՞ . ̫ .՞)"‬