そうですねー。
施設の本体は、かなり地下に作られているみたいです。
封魂結晶を作った時には、それが機能するのは数百年後かもしれないということを予測していたみたいですね。実際に数百年後に目覚めたわけですし。

詳しい理由は、第３部くらいに書く予定なので、だいぶ先になってしまうかもしれませんが。