コメントありがとうございます。
「中尉殿」でも十分だとは筆者も思っています。参謀やら何やらもっと偉い人がわらわら出てくるので、正直敬称の使い分けが面倒臭かったり。
一応独立部隊の長で名目上は医師なので偉いのは偉いんですよ、彼女。