410年、五斗米道（ごとべいどう）の廬循（ろじゅん）が決起。参謀の徐道覆（じょどうふく）が何無忌（かむき）を敗死させ、その勢いのまま建康（けんこう）に向けて進軍した。このニュースに建康の人々は恐れおののいた。

諸葛長民（しょかつちょうみん）は兵を率いて建康の防備を固めた。その上で上表する。

「妖賊どもは造船のために多くの木を伐採していたが、南康相（なんこうしょう）郭澄之（かくちょうし）は数年もの間その事実を隠蔽していた。水面下で五斗米道と繋がり、何無忌を欺いていたのだ。その罪は斬罪に値する」

しかし、郭澄之が罪に問われることはなかった。

五斗米道軍は廬循と徐道覆の足並みが余り揃ってはいなかったのだが、それでも劉毅（りゅうき）を破り、共に長江（ちょうこう）を下り、建康に迫った。建康の人々の恐慌ぶりは甚だしく、諸葛長民も、安帝（あんてい）を長江の北に避難させた方が良いのではないか、と劉裕（りゅうゆう）に提案した。しかし劉裕は却下し、諸葛長民と劉毅を北陵（ほくりょう）に布陣させた。

五斗米道の乱が平定されると、諸葛長民は督（とく）豫州揚州（よしゅうようしゅう）六郡諸軍事（ろくぐんしょぐんじ）とされ、豫州刺史（よしゅうしし）として転任、淮南太守（わいなんたいしゅ）を兼任することとなった。

及何無忌為徐道覆所害，賊乘勝逼京師，朝廷震駭，長民率眾入衞京都，因表曰：「妖賊集船伐木，而南康相郭澄之隱蔽經年，又深相保明，屢欺無忌，罪合斬刑。」詔原澄之。及盧循之敗劉毅也。循與道覆連旗而下，京都危懼，長民勸劉裕權移天子過江。裕不聽，令長民與劉毅屯于北陵，以備石頭。事平，轉督豫州揚州之六郡諸軍事、豫州刺史，領淮南太守。

（晋書85-14）