拝復　拙い作品お読みいただきありがとうございます。
ご質問の件ですが、以下、お答えいたします。

二塁手と控えの名を叫ぶ声は、この章の「美馬高校側のスタンドは閑散たるもので、野球部OB、部員の家族親類、そして二塁手と控えの三年生の彼女が前の方に集まっているだけだった」の文中の「彼女」です。

ナインは全員整列しているのですが、彼女の声を聞いて、二塁手と控えの二人が観客席にいる彼女の方に駆け寄った、というシーンです。

世界の中心で愛を叫ぶ！　という感じでしょうか。

あまりくだくだしく書くと台無しになりかねない場面だと思い、ぎりぎりまで説明を省きました。恋愛ものが本当に苦手で、このような場面を描くのは、自分の中ではまさに未踏の境地に踏み込む「チャレンジ」でした。ご指摘通り、わかりづらい面が相当あるかと思います。
読み返して、検討したいと思います。

リアルで考えると、試合後の応援に対する整列・挨拶の場面で列を抜けて「勝手な行動」をするのは基本あり得ないのかもしれません。このへんは、狸に化かされているとでもいうことにしておきましょう(^-^)