科学が進んだため、錬金術等が消え去っただけで、錬金術が極められなかった、という事実はあるけども、ダメだった、という証明ではないですね。何かが足りなかった、のかもしれないし、それは研究を継続していかなければわからないこと。
基本概念や考えかたがおかしなものであれば、そこまでのめり込むひとは多くなかったはずなので、錬金術研究者が多かったという事実、が、なんらかしらの多くの側面をも持っていたのではないでしょうか。
なので主人公の「保留」の先が楽しみです！