聖女さんがおかしくなっているのは、女神崇拝が理由ではないです。

聖女の異常性については主人公は身を以て体験していましたが、あの場では守る者が居たので実際に事を起こされるまで手出しはしないつもりでした。何もなければそのまま村に帰るつもりでした。

シルフであるティーミアを良しとしている事については、聖女さんの友人であるルルウェルの調査で『村に移住したシルフは無害である』と聞いていたからです。

逆にリリムを良しとしないのは、その正体を隠していたからですね。
何を企んでいるか分からない。害を及ぼす前に殺しましょう。
という事です。

『聖職者とはいえ目の前に復讐対象がいるのにルーゴさんは冷静ですね』
冷静ではありませんでした。
正体を隠しているのにも関わらず、自身がルークであると匂わせるような失言をしたりと色々やらかしてます。他には不機嫌そうに返事をしたりなど。

以上です。
分かり難かったらごめんなさいぃ｡ﾟ(ﾟ´ω`ﾟ)ﾟ｡