ファルマコは『創り主』と異なり、やることはやるものですからファウストもその辺りは信任しているのでしょうね。
多分、最初の邂逅の時に正体を見破った辺りからある程度の評価は頂いているかと思います。
ですが、最大の安心はウリエルがいるからでしょうね。
更にグノーシスやルクスも健在ですから。