質問ありがとうございます(*^▽^*)

早速、お答えしますと
魔石の品質を表す等級に幅があるためです。

10等級の魔石というのは、正確には10㎝以内の大きさの魔石を指しています。
つまり、5㎝の魔石もあれば8㎝の魔石もある、というように等級内でも価格に差が出てしまうのです。

この価格の差は魔石の大きさだけでなく、内包魔力やその他幾つかの査定基準によって決められます。
実際に価格を決めているのは、測り知る者《オクルス》という遺物ですので、協会の負担はそんなに大きくは無いですよ。

同じ種のモンスターであっても個体差があるように魔石の品質にも個体差があります。

10等級の魔石であれば、大体500円前後という風に考えていただければいいかと思います。