独り立ちといいましても、まだヴァリニャーノ師は有馬にいますので、長崎と有馬という至近距離に離れているだけですが。
でも間もなく、本当の別れの時が参ります。

ちなみに信長公がイエズス会に賜った安土城の屏風図ですが、ヴァリニャーノ師はローマまでは戻らずゴアどまりだったので、四人の遣欧使節がちゃんとローマまで持っていってローマ教皇グレゴリウス13世に献上しています（公式には「法王」ではなくて「教皇」です）。
ただし、そのあとが全く行方不明なのです。
現在も多くのプロジェクトチームが血眼になってその行方を調査していますが、まだ見つかってはおりません。
もし見つかれば国宝級です。
日本の文化庁も、もしこれが見つかったらその時は安土城天主閣を再建するという条件にしています。