一話の時点で、12歳だったってことですね。
うーん。
いろいろ病気の設定を考えてらっしゃることはわかります。わかりますが、一読した、なにも知らない読者の立場として、やはり「なんであの時点で病気だってわかったの？」と思ってしまいます。だって今回のこれがはじめての遡行だったんですよね。発症は精神的なものらしいし、遡行が一度もない段階で、どうやって発見できたのでしょう？？
いっそ、今回のが2度目の遡行ということにして、主人公とヒロインが出会ったとき、ヒロインの実年齢が24歳、ということではだめなのでしょうか。
そのほうが読者としてはスッと納得できるのですが……「珍しい病で、見た目でもわからないのに、なんでわかるんだよ」という疑問が、どうしても拭えませぬ……(；´Д｀)


追記：
はい、資料にはあると思います、わかりますよがんばって考えてることは。
それでもやはり、引っかかるのです。
読者はじっくり読んでくれません。ちょろっと書いて「ほら、ここにちゃんと書いてある」というスタンスでは作家にはなれません。ちょっと読み飛ばしてもちゃんとわかるように、誤読しないように、わかりやすく書くことも大切なのです。