アイディアが沸いてくる限り、似たようなモチーフを使うのも絶対にダメというわけではないと思いますが、マンネリや頼りすぎになってしまってはいけませんね。

自分も、書き直しや、当初予定していたのとは大きく異なる展開になるということはよくあります。長編となると、全てが予定通りにいったことなんてないかも。
物語って、時に作者でも制御不能になる生き物なのですよね(#^^#)

自分も似たようなモチーフを使うことが多いです。
これを得意分野と見るか、それとも描ける幅が狭いと見るか(^_^;)

プロットを考えてる途中、大幅変更することってありますよね。
そして執筆中でも、同じ現象が起こるかもしれません。大変ですけど、より良い物語を作るための試練と思いましょう(っ`･ω･´)っ