既出ネタかもしれませんが、登録件数順にまとめてみました。
たぶん５０個しか設定されてないはず。
01.短編（4,489）
02.恋愛（3,898）
03.カクヨムオンリー（3,737）
04.ライトノベル（3,308）
05.学園（3,073）
06.異世界（2,086）
07.魔法（2,032）
08.青春（1,687）
09.詩（1,220）
10.日常（1,211）
11.コメディ（1,204）
12.バトル（1,132）
13.シリアス（927）
14.ほのぼの（799）
15.純文学（753）
16.超能力（719）
17.友情（714）
18.お仕事（656）
19.ハーレム（551）
20.女性向け（547）
21.近未来（542）
22.異世界転生（541）
23.ロボット（531）
24.勇者（479）
25.戦争（474）
26.ボーイズラブ（464）
27.魔王（458）
28.家族（450）
29.切ない（437）
30.純愛（430）
31.探偵（409）
32.ガールズラブ（397）
33.歴史（396）
34.ボーイミーツガール（378）
35.妖怪（365）
36.ミリタリー（361）
37.主人公最強（351）
38.異能（311）
39.戦記（306）
40.人外（298）
41.群像劇（294）
42.ハッピーエンド（288）
43.ダークファンタジー（219）
44.グルメ（196）
45.ヤンデレ（183）
46.完結済（183）
47.VRMMO（162）
48.デスゲーム（150）
49.TS（123）
50.スポーツ（112）
以上です。
タグ設定する時の参考になるかもと思って調べたんですが、タグ登録件数の多い、
SF（1,381）
冒険（705）
魔法少女（172）
ダンジョン（132）
などは「人気のタグ」で今回確認できず。
どうやら登録件数の多い順で表示されているわけではないっぽいです。以前は見かけたような気もするので単なる勘違いかもしれませんが……。
ともあれ、ざっくりこんな感じになりました。間違ってたらスイマセン。