第一部 【●の所在】
第０章 ネオミナトミライ篇（上・下） ６話
第１章 ヴァナラ・ミュール討伐篇（上・下） （１話）+６話
第２章 円環の盟約篇 ５話
第３章 ＮＭＭ都市クーデター篇 ６話
＊「始まりのステラ１」
＊「異邦の運び屋１」
第二部 【●の責任】
第４章 マリアナ海溝鉱山篇 （旧：青富士噴火篇）
第５章 ゲート崩壊篇
第６章 藍染の領域篇
第７章 リヴァイアサン迎撃篇
＊「EXE.少女シリーズ１」
第？章 （第二部）短編集（日常話）篇
第？章 無色の王冠篇（短篇完結）
＊一年後
第三部 【●の品質】
第８章 ラウンドゼロ篇
第９章 ラウンドゼロ篇
第１０章 深度γネット篇
第１１章 深度γネット篇
第？章 （第三部）短編集（日常話）④篇
第四部 【●の性能】「＋α」
第１２章 第二次東京決戦篇①
第１３章 第二次東京決戦篇②
＊「異邦の運び屋１６」（完）
第１４章 第二次東京決戦篇③
第１５章 第二次東京決戦篇④
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閑話
第？章 （第四部）短編集（日常話）⑤篇
＊三年後
第五部 【●の重量】
第１６章 人造神話篇（上）
第１７章 人造神話篇（下）
第１８章 天獄楽篇（上）
第１９章 天獄楽篇（下）
第六部 【●の型番（種類）】
第２０章 思想汚染篇（仮）
第２１章 民族浄化篇（仮）
第２２章 精神断絶篇（仮）
第２３章 文化波瀾篇（仮）
閑話
第？章（第六部）短編集⑥篇
第七部 【●の期限（起源）】
第２４章 漆黒の起源篇
第２５章 純白の終焉篇
第２６章 色彩の領域篇
第２７章 （最終章）
＊章タイトルは適宜、改題することがあります。
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シリーズ名一覧（時系列順）
＊■■■■XIII（ロンドン）
０．始まりのステラ
EXE.少女シリーズ
＊（隕石群＋色彩のモノリス落下）
１．オルトレコード（Blackout）
２． 〃 （The dawn）
３．異邦の運び屋
４．√5（仮）
５．その始末書、アナログにつき（仮）
６．クロノスレクイエム
（一般公開用）