不知火白夜

ルビを設定する単語の前に「｜」(バーティカルライン)が挿入されているかを確認してみて下さい。
無い場合は、下記のように変更して下さい。
「闇夜の太陽船《メセケテット》」→「｜闇夜の太陽船《メセケテット》」

「｜」は、ルビを振る文字の始点を表す記号で、《 》に囲まれた文字がルビとなります。
そうすることで、この場合は漢字以外の部分も親文字に含められます。

なお、解決しましたら、このコメントはご自由に削除してくださって結構です。