１００話越えても問題無いです。
ファーストファンタジー、４００話越えてましたから。
運営さんに質問するのがいいと思います。
（＾＾；

…？
普通に100話以上公開している作品なんてたくさんありますからね。特に規約違反が原因とは思えませんが。
ワークスペースのアカウントメニューから要望で質問を送って確認してみてはいかがでしょうか。