ストーリーはプロットがあるかないかでも変わってきますよね。プロットありならそれほどぶれないし、矛盾とかも起きにくい。訂正もできますし、だいぶ楽かと。
でもプロットなしだと、その場の勢いとかで変わってくるので、あとで読み返して訂正する必要があるかもしれません。
私はある程度、頭の中で設定を作ったり、世界観を作ったりするので勢いがあってもなんとかごまかせるのですが、頭の中で、というのはけっこう大変なので、一概にオススメはできないんですよね。
いずれにしても最初の作り込みが甘いとおかしなところ、矛盾が生まれると思います。
キャラ、プロット、世界観、この辺りを突き詰めて考えるといいのでしょうね。