DNAフィンガープリント

フィンガープリント=指紋


DNAのミニサテライト(マイクロサテライトより少し長い配列)はその繰り返し回数などについて変異に富んでおり、個体レベルで識別可能なほどである。そこで、このミニサテライトをプローブ(探針)として扱うことで、遺伝的多様性を検出しようというものである。


検出方法にはいくらかの手法があるようだが、ここではサザンプロット・ハイブリダイゼーションを取り上げる。


まず、サザンプロッティングとは、放射性同位体などを使って標識した短い塩基配列を用いて、その配列と相補的な配列を見つけ出す手法である。

何らかの制限酵素で処理し、その産物を電気泳動させてメンブレン(膜)に吸着させるなどして転写し、転写後の膜に標識したミニサテライトをハイブリダイズさせて目的の配列を探す、というものである。


RAPDやAFLPも、フィンガープリント法の一種といえる。

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