お読みいただいてありがとうございます。まとめて返信させていただきますね。

ＷＰが出た当初というのは作った側も良く運用方法が分かっていなくて、ＷＰに攻撃されている側もＷＰ本体を倒すよりも動かしている人間を倒した方が早い、となったために指揮所が狙われたりなんだりと危ういことが起きたわけですね。現在は運用ルールが整備されて、幾分かその危険は緩和されている、というのが作中の状況になりますね。もちろん、それで完ぺきに守られているかと言えば必ずしもそうではないのも作中で語られている通りですが。