エリアが違うからじゃないですか？
１期では無かったモノレールが存在するということは、それは時代の違いではなくて場所が違うからだと考える方が筋が通ります。
それと、モノレールや１期に登場したケーブルカーのような「決められた地点から決められた地点まで、決められた専用の軌道を移動する乗り物」は、「ある程度平らでしっかりした地面があれば、比較的自由にどこへでも行ける乗り物」であるバスの代替品にはなり得ません。
たまたま描かれなかっただけで、このエリアにもバスかそれに類するような自由度の高い交通機関は存在していたのではないかと想像します。