発動条件がありえないもので継承が不可能だったり。
たとえば、逆巻く竜巻の中でそのエネルギーを利用しないと発動しないとか、真空中じゃないと使えない、ピラミッド形状の中の一点でしか使えないなどなら、継承するための練習が不可能で途絶えることも。

他の分類に飲み込まれたり、分類を分ける途中に失われたりする事もありそうですね。
漆黒魔法の中二感がたまらない！

口伝のみで伝承していた場合、規模の小さい魔法なら弟子をとる前に後継者が倒れることは有り得ない事ではないからなぁ。
後は現存する魔法の中でも小さな区分で見れば途絶えた物は結構ありそう。
他の魔法でより簡単で効率的な物が出たとかも失伝に繋がりそうだし。