自主企画のものです。
　ご質問の方、答えさせていただきます。

　敵組織の構想はあるが、相対するまでの展開が難しいとの話ですね。
　展開に行き詰まった時に便利なのは『その展開に至る目的を明確にして段階的に展開にする』です。

　その展開に至る目的は質問内容だと『異能バトルをする』が目的なのでこれを三段階に分けて考えます。

　一段階目『バトルは突然起こらないと割り切る』
　目と目があったらポケモンバトル！！なんてものは小説にはほとんど無いわけで、必ずバトルが起きそうだなぁ､､､､という展開があるはずです。

　例えば敵組織視点を一つ挟むとか、裏切り者がいる〜的な会話をするとか、敵襲が来たらしい！！戦う事もできるけど一旦エルを避難させよう！とか、バトルが起きるきっかけを作ることが第一段階です。

　二段階目『戦う理由を作る』
　きっかけが出来て敵が来た！！よし殺そう！とはなりませんよね？まぁ戦闘狂なら知らんけど。そこで分かりやすく明確な理由を作ること。
　例えば、エルが狙われた！因縁とかわからないけど、保護している以上守らなければ！！とか、同僚やらが傷つけられた！はいぷっちーん、お前ら殺します。とか、避難したいけどできない！！よし戦おう！！とか戦う理由を作るのが第二段階目。

　三段階目『逆算をしてみる』
　最終的にどんな終わり方にするか考えてみる。敵は断片的な能力しか使っていないのに強い！とか、主人公が死にそうになった！とか、敵が諦めてくれるとか、最終的にバトルはどうなるのかを考えて逆算をすると書きやすくなります。これが第三段階目。

　これでも思いつかない！のならば思い切って何も考えずバトルシーンを書きましょう！！モチベが一番。
　展開に行き詰まったらやってみましょう。レッツライティング！！

自主企画の参加、ありがとうございます。」
　不躾ながら企画に沿った形で感想、アドバイスを送らせていただきます。

　基本に忠実でとても読みやすく、『恐怖症』を能力にする設定もだいぶ好みです。この小説の紹介文で『確保、収容』が出てきてSCP好きの私としてはちょっとテンションが上がりました（笑）あとは『保護』があれば完璧！！

　と少し脱線しましたがここからはアドバイスに移行しますね。気になった点としては『ぱっと見の主人公』と『設定の照らし合わせ』です。

　一つ目は、一話目でのファーストイプレッション。この作品の主人公は誰なのか？という点です。

正直、一話目の冒頭で主人公が誰かわかりませんでした。私の読解能力が低いという可能性も全然ありますが､､､､
　三人称はそこら辺が難しいですが、誰でも簡単に分かりやすく「この人が主人公です！！」と伝えるのであれば『PSOビル内、そこで働いている一人の女性がいた。その名はフクと言い､､､､､』かなぁ。

　自分で書いていてもなんですがめちゃくちゃダサい気がしてきました。ダサかったら言って下さい。めちゃくちゃ気になっているので。


　二つ目は『設定の照らし合わせ』。これは冒頭のモノローグと二話目での少女の設定の違いです。

　モノローグでは9〜10歳でしたが第二話では10〜12歳と書いています。どちらかに合わせましょう。こうゆうSF作品では設定の食い違いやミスが多くなるので下書きに設定を書いておくと安定します。

　最後に付け足しますが『モノローグ』はキャラクターのセリフだけで構成されている序章です。なので、この作品では『プロローグ』の方が正しいと思います。


　基本はできており、初めてとは思えないほど綺麗な文章でした。正直言いますと最初アドバイスする点が見つからなかったので目を凝らしてなんとか捻り出したんですよね（笑）
　読み進めていくとはまっていく文章、設定なので最初の掴みを頑張ってほしいと思いました！！長文失礼しました。質問等ありましたら返信で申し付け下さい。

これからも頑張って下さい！！

追記
ロボトミ履修済みです！！テンション爆上げ！！

戦闘しておくれ