　物語は、江戸時代の日本を舞台に展開します。中村主水率いる仕事人集団「必殺の一党」のメンバーである伊原剛志、城田優、上戸彩、役所広司、城島茂、そして新たに加わる宇治川が、忍者の技と剣術を駆使して悪人と対峙します。

彼らは、様々な依頼を受けて悪人の罪を裁くための暗殺を行います。しかし、その中で裏切り者が現れ、一党の絆に亀裂が生じます。裏切り者の真の目的や、仕事人たちを引き裂く因縁が明らかになり、物語は更なる複雑さとドラマチックな展開を迎えます。

中村主水は仲間の裏切りに激怒し、彼らの因縁と裏切りの真相を解き明かすために復讐を誓います。伊原剛志と城田優は主水の意志を尊重しながらも、その真意を知るために彼の後を追います。上戸彩は裏切り者の秘密に近づくため、自身の忍者の血筋を活かして戦いを繰り広げます。役所広司は組織の陰謀と因縁を解き明かし、裏切り者たちとの対決に臨みます。そして、新たに加わる宇治川は、仲間たちの裏切りと訴える相反する感情の中で、自身の使命を見つけるために奮闘します。

物語は、忍者の技と剣術、裏切りと因縁に揺れる仕事人たちの闘いを描きながら、陰謀の解明と復讐の道への追求に進んでいきます。彼らは裏切り者たちとの戦いの中で、自身の忍者の術と覚悟を磨きながら成長していきます。絆や信頼の重要性も物語に絡みついています。