　新学期が始まり、仲村トオル演じる学園の校長先生は、藤田まこと演じる理事長と共に、川口春奈演じる明るく元気な女子生徒・宮本さくらを迎える。

一方、MEGUMI演じる教師の水田は、自由奔放で問題児の鷺沢（日村勇紀演じる）に振り回され、悩みながら日々を過ごしていた。

そしてある日、学園に危機が訪れる。突如、学園を襲う未知のウィルスが発生し、生徒たちは次々と倒れていく。

彼らの救いの手を差し伸べるのは、出川哲朗演じる感染症の専門家・大山であった。

しかし、ウィルスの拡散は止まらず、学園は完全封鎖されることになる。

そんな中、菊池桃子演じる保健医師の出現によって、生徒たちは一丸となり、校内での感染拡大を防ごうと奮闘する。

水田も、自分の力を信じ、鷺沢をはじめとする生徒たちと協力しながら、解決策を探す。

そして、最後には全員の力を結集し、ウィルスを撃退することに成功する。

学園は危機を脱し、新たな勝利への道を歩み始める。

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