失礼します。
面白いと思ったので、良い点と改善出来そうな点を言わせてもらいます。
上から目線みたいで申し訳ございません。

良いところ

① 「ルッキズム＝怪物」という設定がかなり面白い
現実の「ルッキズム（外見による人への評価）」を、実際に人間を傷つける怪物として具現化しているのが特徴的です。単なるモンスターではなく、人間の内面から生まれる存在なのが物語のテーマにつながりそうです。

② 冒頭の日常描写から任務への切り替えが自然
「寝癖」「靴紐」「制服」といった普通の学生生活から、突然「武器を持って排除せよ」となるので、この世界では戦闘任務が学生の日常になっていることが伝わります。

③ ルナとミサキの会話がキャラクター紹介になっている
「怖い？」→「菅原先生に怒られるのは怖いかな」という返しだけで、ルナのマイペースさがかなり伝わります。説明文だけで性格を説明していないのが良いです。

④ 「救助もとい排除」が気になる
ここはかなり良い引きです。
「なぜ救助と言い直したのか？」「救助対象と排除対象は同じなのか？」など、読者に疑問を残せています。

改善できそうなところ

① 「45日目」の意味を少しだけ匂わせてもいい
タイトルが「45日目」なのに、本文ではまだ45日目が何を意味するのか分かりません。
あえて謎にするならOKですが、例えば「この生活が始まって45日目」など、読者が推測できる小さな手がかりがあるとタイトルがより効きます。

② ルッキズムの説明をもう少し後ろに分散してもよさそう
「人間の自己否定から生まれた」「身体・精神に害を与える」と一気に説明されるので、やや設定説明感があります。

実際に第4地区でルッキズムを目撃したあとに、「そういう怪物だった」と説明する形にすると、先に恐怖や謎を見せてから設定を理解させる構成にもできます。

③ 「ルナがワクワクしている理由」がもう一歩あると魅力が増す
「どんなのだろうね」というセリフは、ルナの好奇心を表現する良い部分です。
ただ、なぜ怖いのに興味を持つのかが少し謎なので、過去に図鑑でルッキズムを調べていたなど、ほんの一言あると個性がさらに立ちそうです。

④ 第4地区に着いたところで、視覚的な異常を一つ入れてもよさそう
最後が「地に降り立った」で終わるので、次のページへの引きとしてはもう少し強くできます。

例えば、街の様子がおかしい、遠くから警報が聞こえる、誰もいない、建物の壁に奇妙な跡がある……など、「ここから何かが起こる」具体的な違和感を一つ置くと、かなり続きが気になります。