＞・二話目以降の下書きができない。執筆中などに書いておいてコピペするようだ。

　これは形式の違いに慣れないことからくる誤解でしょうね。
　私は最初に「小説家になろう」を使って、その後「カクヨム」など他のサイトを使うようになったので大丈夫ですが（サイトによって違うんだ、程度の感覚でしたが）、なるほど、後から「小説家になろう」へ行くとこう感じるのだな、と勉強になりました。
　私もいくつかのサイトに登録してきましたが（すでにサービス終了したところも含めれば「小説家になろう」「カクヨム」「セルバンテス」「エブリスタ」「ステキブンゲイ」「ノベリズム」「NOVEL DAYS」「Prologue」の順に登録してきました）、ほとんどのサイトでは「カクヨム」と同じ形式なのに対して、「小説家になろう」だけは別なのですよね。「小説家になろう」では下書きが作品ごとに分かれているのではなく、どの作品も同じ「執筆中小説」という項目にまとめられています。ただし、これはそこから投稿時にコピペする必要があるわけではなくて「執筆中小説を投稿する」の欄の「▽執筆中小説を選択してください」から選択できます。
「執筆中小説」の項目にいくつか下書きをストックしておけば「次話投稿」の「本文」の項目において「直接入力する」ではなく「執筆中小説を投稿する」がデフォルトで選択されているはずですが（実際にあちらの自分の連載中作品の「次話投稿」画面を開いて確認しながらコメントを書いています）、もしも「執筆中小説」の項目に何もないと「直接入力する」がデフォルト表示になるのでしょうか？（そのために「コピペしていちいち入力する必要ある」と思ってしまったのでしょうか？）

　この「作品とは独立して執筆中エピソードが保存される」という仕様は、純粋に「下書き」として使うにはとても便利だと感じています。例えば私は、ルビなどを除いた文字数を知りたい時、なろうに投稿する気のない（投稿できない）作品でもなろうの「執筆中小説」に入力して、そこで文字数をカウントしています。
　カクヨムで同じことをやろうとすると、下書きも作品管理画面の支配下にあるので、何かの拍子に（うっかりクリックして）間違って投稿される可能性があるかも、と思えて怖くて出来ません。