第一話「豪華客船」　

第二話「大海原の旅」

第三話「和ノ国」

第四話「忍びの里」

第五話「忍者」

第六話「カラクリ屋敷の主」

第七話「月鈴の儀」

第八話「迅」

第九話「儀のはじまり」

第十話「雷太郎と風太郎」

第十一話「竜山の試練」

第十二話「月鈴草」

第十三話「ヤミノイッパ」　

第十四話「洞窟」

第十五話「帰還」

第十六話「竜神祭」

第十七話「半年後」

第十八話「カラクリ屋敷の錬」

第十九話「ステファンの知恵」

第二十話「対決！忍者犬ムサシ」

第二十一話「軍師の秘策」

第二十二話「祝勝会」

第二十三話「十年前の戦い」

第二十四話「里の外へ」

第二十五話「宮之屋の酔っ払い」

第二十六話「初任務～徳吉と千代～」

第二十七話「調査開始」

第二十八話「失踪の理由」

第二十九話「探索」

第三十話「陰謀の影」

第三十一話「花咲山へ」

第三十二話「平和の『信』と隠密の『疑』」

第三十三話「カラクリ職人ベン」

第三十四話「招かざる客」

第三十五話「再会」

第三十六話「カガク」

第三十七話「襲撃された忍びの里」

第三十八話「龍脈の力」

第三十九話「出陣」

第四十話「鶴山城潜入」

第四十一話「激闘」

第四十二話「流vs不比等」

第四十三話「カラクリ兵器『鬼』」

第四十四話「鶴山城の忠臣」

第四十五話「仇」

第四十六話「エミーラ奪還作戦会議」

第四十七話「龍鈴の錬」

第四十八話「紫電の物語」

第四十九話「あの日のこと」

第五十話「都へ」