ストーリー的にはMMO仲間がでなくても進行に何の問題もありませんが、個人的にはMMO仲間の状況は定期的に知りたいです。
一読者としては主人公の最初の選択が果たして正解であったのかどうかを確かめたいという思いがあります。
この命題は安易に答えを出せるものではなく、主人公とMMO仲間を見比べながらじっくり考察する必要があり、定期的な近況報告が不可欠です。
とはいえ、ストーリー的には不必要である以上、Web版に関してはこれで良いと思います。

というわけで、書籍版・漫画単行本、両方とも買います！

『MMO仲間を出さない』という仕様は理解できたけれど、主人公が仲間たちの事を忘れてしまったかのように気にする描写が出てこないのは不自然な気がしました。

個人的にはweb版が好きです。あんまり他の人の視点が入るとテンポが悪くなる事もありますし。あんまり読者の意見や編集者の意見に左右されずに作者様の自由に書いていただけたらと思います。